BIOWISSENSCHAFTEN

Bernecky Group

RNA-basierte Genregulation

Die regulierte Expression von genetischem Material ist einer der grundlegenden Prozesse in der Zelle, der von der Entwicklung des Organismus bis zu seiner Reaktion auf die Umwelt alles beeinflusst. Durch Untersuchungen der Struktur beteiligter Komplexe entwirrt die Bernecky-Gruppe die regulatorischen Netzwerke der Gen-Expression, die RNA als Zwischenglied nutzen.

RNA ist ein zentraler Punkt in der Regulation der Gen-Expression. Sowohl protein-kodierende als auch nicht-kodierende RNAs sind integrale Bestandteile verschiedener Regulationswege. Dabei agieren sie oft gemeinsam mit Protein-Kofaktoren. Obwohl sie eine wichtige Rolle spielen, fehlt ein Verständnis der Wirkmechanismen der beteiligten RNA-Protein Komplexe. Viele dieser RNA-enthaltenden Komplexe sind flexibel, modular und nur in geringer Zahl vorhanden. Für solche schwierigen Ziele hat sich die Kryo-Elektronenmikroskopie (Kryo-EM) als besonders leistungsfähige Methode zur Bestimmung der Strukturen auf nahezu atomarem Niveau erwiesen, das gleichzeitig auch Einblicke in ihre Dynamik liefert. Die Bernecky Gruppe verwendet diese und verwandte Methoden, um zu verstehen, wie Komplexe aus RNA und Protein entstehen und den zellulären RNA Metabolismus regulieren.

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Team


Current Projects

Molekulare Grundlage der Transkriptionsregulation | Hemmung der Transkription durch nicht-kodierende RNA | Substrat-Erkennung durch RNA-modifizierende Enzyme


Publikationen

Bernecky CA, Plitzko J, Cramer P. 2017. Structure of a transcribing RNA polymerase II-DSIF complex reveals a multidentate DNA-RNA clamp. Nature Structural and Molecular Biology. 24(10), 809–815. View

Xu Y, Bernecky CA, Lee C, Maier K, Schwalb B, Tegunov D, Plitzko J, Urlaub H, Cramer P. 2017. Architecture of the RNA polymerase II-Paf1C-TFIIS transcription elongation complex. Nature Communications. 8. View

Engel C, Gubbey T, Neyer S, Sainsbury S, Oberthuer C, Baejen C, Bernecky CA, Cramer P. 2017. Structural basis of RNA polymerase I transcription initiation. Cell. 169(1), 120–131.e22. View

Bernecky CA, Herzog F, Baumeister W, Plitzko J, Cramer P. 2016. Structure of transcribing mammalian RNA polymerase II. Nature. 529(7587), 551–554. View

Sainsbury S, Bernecky CA, Cramer P. 2015. Structural basis of transcription initiation by RNA polymerase II. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 16(3), 129–143. View

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Karriere

seit 2018 Assistant Professor, IST Austria
2011 – 2017 Postdoc, LMU Munich and MPI for Biophysical Chemistry, Göttingen, Germany
2010 – 2011 Postdoc, University of Colorado Boulder, USA
2010 PhD, University of Colorado Boulder, USA


Ausgewählte Auszeichnungen

2012 – 2014 Humboldt Research Fellowship
2005 – 2007 NIH Molecular Biophysics Training Grant
2002 Hughes Undergraduate Research Scholar (Cornell-HHMI)


Additional Information

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