System- und synthetische Biologie genetischer Netzwerke

Die Guet Gruppe beschäftigt sich mit Systemen aus Genen und Proteinen, die genetische Netzwerke in Bakterien bilden. Diese biomolekularen Netzwerke befinden sich fortwährend im Prozess der Entscheidungsfindung, der im Rahmen verschiedener Zeiträume erfolgt: von Sekunden bis zur Dauer der Teilung einer Zelle und darüber hinaus. Durch das Erforschen bestehender Netzwerke und durch den Aufbau neuer Netzwerke in lebenden Zellen mit Ansätzen der synthetischen Biologie sollen allgemeine Regeln entdecken werden, die biologische genetische Netzwerke steuern.

Die Gruppe verwendet Escherichia coli als Modellsystem und interessiert sich für mikrobielle genetische Systeme, weil diese relativ einfach aufgebaut sind und leistungsstarke experimentelle genetische Werkzeuge für sie vorhanden sind. Der Forschungsschwerpunkt liegt auf der Molekularbiologie und -physiologie von Einzelzellen, weil die Messung vieler Zellen das Verhalten einzelner Zellen verdeckt. Um die zeitliche Dynamik der Genexpression quantitativ zu bestimmen, werden minimal invasive In-vivo-Techniken eingesetzt und entwickelt.

Kontakt
Călin Guet
Institute of Science and Technology Austria (IST Austria)
Am Campus 1
A – 3400 Klosterneuburg

Tel: +43 (0)2243 9000-4001
E-mail: calin.guet@remove-this.ist.ac.at

CV

Publikationsliste

Assistent
Louis Alesch

Tel: +43 (0)2243 9000-1032
E-mail: louis.alesch@remove-this.ist.ac.at

Team

  • Anna Andersson, Postdoc (jointly with Tkacik Group)
  • Remy Chait, Postdoc
  • Rok Grah, PhD Student (jointly with Tkacik Group)
  • Kirti Jain, Postdoc 
  • Claudia Igler, PhD Student
  • Mato Lagator, Postdoc
  • Moritz Lang, Postdoc
  • Anna Nagy-Staron, Postdoc
  • Nela Nikolic, Postdoc
  • Magdalena Steinrück, PhD Student
  • Isabella Tomanek, PhD Student
  • Kathrin Tomasek, PhD Student (jointly with Sixt Group)

Aktuelle Projekte

  • Informationsverarbeitung bei komplexen Promotoren
  • Systembiologie von Mar Regulon

Ausführlichere Informationen zur Forschungsgruppe entnehmen Sie bitte der englischen Version.

Ausgewählte Publikationen

  • Pleska M, Lang M, Refardt D, Levin B, Guet CC. 2018 Phage-host population dynamics promotes prophage acquisition in bacteria with innate immunity Nature Ecology & Evolution 2: 359-366
  • Steinrueck M and Guet CC. 2017. Complex chromosomal neighborhood effects determine the adaptive potential of a gene under selection. eLife 6: e25100
  • Bergmiller T, Andersson AMC, Tomasek K, Balleza E, Kiviet DJ, Hauschild R, Tkacik G, Guet CC. 2017. Biased partitioning of the multidrug efflux pump AcrAB-TolC underlies long-lived phenotypic heterogeneity. Science 356: 311-315
  • Lagator M, Sarikas S, Acar H, Bollback JB, Guet CC. 2017. Regulatory network structure determines patterns of intermolecular epistasis  eLife 6: e28921
  • Kinkhabwala A and Guet CC. 2008. Uncovering cis regulatory codes using synthetic promoter shuffling.  PLoS ONE 3: e2030

Karriere
2018 Professor, IST Austria
2011 Assistant Professor, IST Austria
2009 Postdoc, Harvard University
2005 Postdoc, The University of Chicago
2004 PhD, Princeton University

Ausgewählte Auszeichnungen
2011 HFSP Grant
2005-2007 Yen Fellow, Institute for Biophysical Dynamics, University of Chicago, USA
1997 Sigma XI Membership

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